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纳米科学奖 (图源挪威科学与文学院) 美国科学家大卫阿利亚拉、中共中央召开座谈拉尔夫诺佐,中共中央召开座谈与以色列科学家雅各布萨吉夫、美国科学家乔治怀特塞兹共同分享纳米科学奖,以表彰他们在固体基材上的自组装单分子层:控制表面特性的分子涂层方面的成果。
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此外,人士其对疾病标记物的识别效率高于其他方法。该模型最特别之处在于,中共中央召开座谈其不是基于微生物丰度,而是基于生态互作网络实现的。不仅肠道微生物如此,党外人体内的基因、蛋白质亦是如此,各种生命分子彼此协作,才构成我们精妙的人体。未来,人士研究团队将继续开发优化计算方法,并在疾病标记物的预测中整合更多的人群特异性信息,助力精准医疗发展。
将这一方法应用到包含多种疾病的网络分析中,我们惊奇地发现,大部分疾病标记物并不只导致一种疾病的发生,而是与多种疾病存在显著关联,这些相似的菌群失调现象可能为不同疾病的共性致病机理提供重要线索。它们构成复杂,成长环境千差万别。
作者:韩扬眉 来源: 中国科学报 发布时间:2022/5/25 9:10:36 选择字号:小 中 大 挖掘菌群社交网 揪出疾病黑手 新算法基于互作网络识别疾病标记物 ■本报记者 韩扬眉 百年前,诺贝尔生理学或医学奖获得者梅契尼科夫曾指出:肠道健康的人身体才健康。肠道菌群的种类、丰度,以及基因表达阵列各有不同,且它们更容易受饮食、地域等各种因素的影响,因此,不同人群之间肠道菌群组成可能存在很大差异。整体认识我们的生命 这一研究进一步验证了肠道内的微生物是一个系统互作、紧密连接的整体。相关论文信息: https://doi.org/10.1038/s43588-022-00247-8 《中国科学报》 (2022-05-25 第1版 要闻)。
论文审稿人认为,基于微生物的生态互作关系来整合不同数据集的方法十分合理且精妙,有助于基础研究在临床上的转化与应用。该研究首次提出基于微生物互作网络的新算法NetMoss,实现高效整合大规模菌群数据以及精准识别疾病标记物。5月23日,《自然计算科学》在线刊发了中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队的最新研究成果。更值得关注的是,就微生物标记物的种类和作用而言,不同研究得出的结论差异很大。
然而,复杂的肠道菌群究竟如何影响人体的疾病与健康? 近年来,关于肠道菌群与人体健康和疾病关系的研究越发丰富,尤其是随着测序技术、基因组研究等的发展,大量研究为该领域积累了海量的生物数据信息。难测的肠道菌群 肠道菌群是一个庞大家族,根据科学家目前掌握的数据,肠道菌群包含500至1000种不同的细菌,基因总数是人类的100多倍。
通过构建微生物互作网络,可以很好地保留每一个子数据集最原始的生物互作信息,通过进一步整合,人们就可以基于更庞大的数据进行生物标记物的挖掘。相同的细菌可能在不同疾病的发生发展过程中扮演着不同角色,它们在人体代谢网络中的位置或功能的小小改变,影响的不是某一个组织或器官,而是整个生命系统。
而这项研究表明,即使是结构不同的肠道菌群,也存在着相似的共性:一批相同的细菌在生态互作网络中占据着关键位置,它们彼此间连接关系的改变,最终导致了多种疾病的发生。从互作中寻找规律 为解决上述问题,研究团队开发了一种高效的数据整合和生物标记物挖掘计算模型。为了摸清肠道菌群的影响和作用,科学家试图找到它们与体内其他器官的某些关联,比如肠脑轴、肠肝轴和肠肾轴等,由此发现了一些与疾病发生密切相关的微生物标记物。赵方庆告诉《中国科学报》,人体是一个有机整体,不能孤立地看待任何一种生命现象。研究团队收集整理了11377例包括疾病与健康对照的肠道菌群测序样本,覆盖78项研究、37种疾病、13个国家或地区。肖力文说,传统观念认为,患病人群的肠道菌群之间存在很大差异。
已有研究表明,肠道生态系统不仅通过菌群交互直接影响着呼吸道、生殖道等,还通过免疫因子、代谢物和神经递质间接影响着人体健康。针对这些来自不同人群的多种数据集,他们提出基于互作网络的新算法NetMoss,开发了一种高效的数据整合和生物标记物挖掘计算模型进行数据分析
不符合预期的数据是绝对不能随便删除的,可以在分析数据的散点图和标准差后,决定是重复一次实验,还是增加样本数。作者:王德华 来源: 中国科学报 发布时间:2022/5/25 9:10:34 选择字号:小 中 大 不符合预期的数据绝不能随便删除 ■王德华 科学是以数据说话的,任何科学结论都需要数据支持。
我们实验室每周都有组会,大家有数据就会在组会上讨论。研究生和导师交流时,也要提供原始数据。
在我们平时的科研工作中,这种情况很常见。如果仅是某个参数不符合预期,可以分析测定过程是否出了问题。这对社会的影响是极大的,尤其是涉及国计民生问题时,错误的数据很可能会导致错误的决策,进而造成巨大的损失。导师检查学生实验记录,也是研究生中期考核、申请学位论文答辩的一个重要条件。
所以,实验科学无论怎样强调数据都不为过。我一般会跟我的学生说,出现个别偏离的数据,要认真分析是不是这个样本有问题,并结合这个样本的其他参数予以考虑。
比方说,如果同一个动物实验中,多个参数都出现了问题,就要考虑可能是动物样本的问题。在我以前工作的中国科学院动物研究所,我负责研究生教育工作多年,研究所学位委员会制定了导师检查研究生实验记录的制度,每学期都要进行检查,记录本上有导师的签字。
(作者系山东大学生命科学学院特聘教授,本文由本报记者倪思洁采访整理) 《中国科学报》 (2022-05-25 第1版 要闻)。我的研究生刚刚获得了一个实验的部分数据,需要统计处理组与对照组的差异,但统计后他发现,有一组数据标准差太大,统计结果是差异不显著。
总之,做实验要尊重原始数据,严肃认真,认真对待每一个数据,认真对待科研和实验过程的每一个步骤,认真做好实验记录。不可以更改数据,不可以选择性地取舍实验数据。面对个别偏离的数据时,我们的处理方法一般有以下三种。为避免不当的数据取舍,应该对实验的原始记录给予高度重视。
第三,根据统计学中判断奇异值的方法,进行个别数据取舍。但这是很危险的,因为随便取舍数据,或根据自己的需要取舍数据、选择性使用数据,就触碰到了学术不端的红线。
研究所为此专门定做了实验记录本,每页都有页码,不能随便撕掉。数据取舍,是我们组会上经常讨论的问题。
如果没有正确对待科学的心态,没有对待科学数据严谨的态度,而是论文至上,再加上没有强有力的监督机制和惩罚措施,出问题是不奇怪的。在讨论的时候,我跟他说:如果个别数据偏离了整个样本的变化趋势,要特别重视,首先分析自己的实验过程是否有问题、样品是否有问题等。
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